【解説】FilmArray®呼吸器パネル2.1による肺炎の検査
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亀田総合病院

8ヶ月前

【解説】FilmArray®呼吸器パネル2.1による肺炎の検査

【解説】FilmArray®呼吸器パネル2.1による肺炎の検査

FilmArray®呼吸器パネル2.1とは

18ウイルス、4細菌の遺伝子を検出

FilmArray®システムは、 multiplex PCR法を用いて、 核酸同定を同時に行う全自動遺伝子解析装置です。 FilmArray®呼吸器パネル2.1は、 鼻咽頭拭い液を用いて以下に示す18種類のウイルスと4種類の細菌の遺伝子を同時に検出することができます。

FilmArray®呼吸器パネル2.1で検出可能な病原体
【解説】FilmArray®呼吸器パネル2.1による肺炎の検査
FilmArray®呼吸器パネル2.1添付文書を基に編集部作成

約1万円と高額な点に注意

短時間で多くのPCR検査を同時に行える利点がありますが、 高額 (診療報酬点数 : 963点) となっています。

ガイドラインでの位置づけ

成人肺炎診療ガイドライン2024においても、 「肺炎診療において多項目遺伝子検査は推奨されるか」 というクリニカルクエスチョンがあり、 弱い推奨となっています。 よって、 FilmArray®呼吸器パネル2.1の実施においては、 適応を慎重に考える必要があります

適応

統一された適応はないが・・・

実臨床におけるFilmArray®呼吸器パネル2.1の統一された適応はないと考えられます。 筆者らのグループでは、 原則として、 ウイルス性肺炎やマイコプラズマ肺炎を疑う入院症例 (特にSARS-CoV-2とインフルエンザの迅速抗原検査が陰性の場合) で提出するようにしています。

筆者らのグループにおけるFilmArray®呼吸器パネル2.1の適応
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注意点

ウイルスによる感度の違い

呼吸器系ウイルスに関しては、 SARS-CoV-2、 インフルエンザを含めて比較的広範にカバーされていると考えられます。 しかし、 感度は対象ウイルスによって異なり、 最近のメタ解析では、 インフルエンザA 91.1%, インフルエンザB 82.2%, RSウイルス 91.1%、 アデノウイルス 67.0%、 ヒトメタニューモウイルス 91.4%と報告されています¹⁾。

特異度はこれらのウイルスにおいて99%以上でした¹⁾。 したがって、 偽陰性が起こり得るため、 FilmArray®呼吸器パネル2.1が陰性だからといって、 ウイルス性肺炎が完全に否定されるわけではありません。

検査する検体による結果の違い

ウイルス性肺炎症例では、 鼻咽頭拭い液や喀痰は陰性でも、 気管支肺胞洗浄液で陽性になる症例が存在します。 したがって検査する検体によって結果が変わる可能性があります (ただし、 気管支肺胞洗浄液や喀痰は保険適用外となります)。

ウイルスと細菌の重複の可能性

細菌とウイルスの重複感染が市中肺炎の5~10%で認めると報告されています²⁾³⁾。 したがって、 ウイルスが検出されたからといって、 必ずしも細菌性肺炎が否定されるわけではありません。

ウイルスの定着の可能性

ウイルスは健常者の気道に定着することもあるため⁴⁾⁵⁾、 ウイルスの検出が必ずしも呼吸器感染症の起炎菌とは断定はできません。

検出可能な細菌の限界

細菌に関しては、 Bordetella pertussisBordetella parapertussisChlamydophila pneumoniaeMycoplasma pneumoniaeの4つのみであり、 Legionella pneumophilaはカバーされていません。 したがって、 重症呼吸器感染症の起炎病原体を評価する場合に、 FilmArray®呼吸器パネル2.1のみでは不十分であり、 Legionella pneumophilaについては尿中抗原検査、 肺炎球菌を含む一般細菌については喀痰グラム染色、 喀痰培養による評価は必須です。

BioFire®肺炎パネルという、 20項目以上の細菌、 非定型肺炎病原体、 ウイルス、 および薬剤耐性遺伝子の5項目以上を検出するパネルが出ていますが、 今のところ保険適用外のため、 まだ国内で広くは用いられていないと考えられます⁶⁾。

出典

  1. Multiplex PCR system for the rapid diagnosis of respiratory virus infection: systematic review and meta-analysis. Clin Microbiol Infect. 2018 Oct;24(10):1055-1063. PMID: 29208560
  2. Community-Acquired Pneumonia Requiring Hospitalization among U.S. Adults. N Engl J Med. 2015 Jul 30;373(5):415-27. PMID: 26172429
  3. The impact of virus infections on pneumonia mortality is complex in adults: a prospective multicentre observational study. BMC Infect Dis. 2017 Dec 6;17(1):755. PMID: 29212450
  4. A prospective, community-based study on virologic assessment among elderly people with and without symptoms of acute respiratory infection. J Clin Epidemiol. 2003 Dec;56(12):1218-23. PMID: 14680673
  5. Identification of respiratory viruses in asymptomatic subjects: asymptomatic respiratory viral infections. Pediatr Infect Dis J. 2008 Dec;27(12):1103-7. PMID: 18978518
  6. BioFire FilmArray Pneumonia Panel enhances detection of pathogens and antimicrobial resistance in lower respiratory tract specimens. Ann Clin Microbiol Antimicrob. 2022 Jun 4;21(1):24. PMID: 35659683
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